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第三阶段为道光年以后,这一时期医案之作发展尤著。由于江浙一带名医辈出,医案佳作非常普遍。书其大略,主流有三:其一是学宗叶、吴而善治温病者,如王孟英、曹仁伯、黄堂、柳宝诒、邵兰荪、张千里、姚龙光、徐渔渡、何淡安、周小农、俞震等数十家医案皆属之。其二是学宗孟河医派者。孟河医派至晚清而成鼎盛,代表医家为费伯雄、马培之。当时名医出于费、马门下者甚夥。承费氏之学者如余听鸿、陈景岐、费绳甫父子和薛逸仙等。承马氏之学者,如丁甘仁(再传程门雪、章次公、黄文东等)、贺季衡、邓星伯、沈奉江、赵竹泉等。孟河医派的医案在治杂证方面善于化裁古方,理法方药,四平八稳,不趋奇异。治疗时疫则兼采叶、吴。马氏门人多精外科,所书医案多医理文采并茂,研读者多兴趣盎然,不忍释卷,因此对医案的写作颇有影响。其三是世医,以江苏陈、何二氏具代表性。陈一族,世代为医,至陈莲舫已19代;何氏至晚清何长治已24世,代有名医。此二氏皆不乏医案佳作,其用药稳健轻灵,书案则按语中肯平正,论理渊博。陈莲舫身为御医,更具宫廷医派之特色。
其他如恽铁樵、张锡纯、陆渊雷等人之医案又另辟蹊径,衷中参西,率先将西方医学结合到中医医案中来。余奉先、曹颖甫、赵守贞、范文虎、陈无咎等医学大家善用经方,所作《冀经经验录》、《经方实验录》等皆能将验方运用自如,屡起沉疴而名闻遐迩。此时全国各地名医无数,如丹徒赵海仙、无锡张聿青、大麻金子久、四川冉雪峰、胥江张仲华以及上海、北京诸多名医皆各领风骚,其医案著作亦各有千秋。书案行文之法有正叙、倒叙、插叙、夹叙之异。分析病机有的删繁存精,有的丝丝入扣,细致入微,或有猎险而惊人,或有书误案以为诫。真是五花八门、琳琅满目,不可胜言。
清代专门整理研究医案的著作已经有多种形式,这是医案学发展到鼎盛的又一重要标志。
人们把魏之臔的《续名医类案》看作是中医医案的第二次总结是不无道理的。魏氏遵照江馞旧例,摘取西汉《史记》至清嘉庆朝之间1800余年的各家医案,亦遍摭经史子集等散在医案,汇成36卷,分证350门,集案约5000则。可说是将古代医案囊括无遗。稍后嘉善人俞震所著《古今医案按》,选案1500余则,证分106门。其特点是选案精,而每类证后的评按文字,每能中其肯綮。对于理解每个医案之病机、辨证关键、医家的独到匠心和圆机活法等等每能发人深省,实为研究医案类书之佼佼者,对后世之影响亦非常深远,如蔡陆仙《中国医药汇海·医案部》、何廉臣《全国名医验案类编》、余瀛鳌《现代名中医类案选》等皆以此书为法要。
医案类书的研究方法已经发展成多种方式,越发体现了医案学的重要地位,其中有以医家为纲,以病证为目而编研者。如乾隆年间杨乘六所辑赵献可门人高、董、吕三家医案而成《医宗己任编》,此作可视为以人汇案和以流派汇案的创始人。其后吴金寿所辑《三家医案合刻》即仿此例,乃选辑叶天士、薛雪、吴鞠通三家的温病治验。光绪间柳宝诒《柳选四家医案》乃汇集尤在泾、曹仁伯、张仲华、王旭高四家医案而成。同仁咸谓这些著作评选皆善,有助后学。还有吴人陆晋笙所辑《重古三何医案》选评亦精。此数家医案类书均不同程度地受到了《医宗己任编》的影响与启发。
还有以专题类案的医案类书,如沈源所辑《奇证汇》,系将罕见病证之医案汇成一帙,以启迪后人。又如余听鸿的《外证医案汇编》则是集陈学山、叶天士、薛生白、缪遵义、徐灵胎等名家的外证医案为一书。这种类案著作使医案研究朝着专题方向发展,本人认为这种研究方法似乎更容易深入和突破。
以上可以看出清代的医案专著空前繁富,众多医家不仅对医案的规范化书写十分重视,而且开始注重医案理论的研究。不同种类的医案类书及评议类医案专著的出现标志着中医医案之研究已经进入高级阶段。