由于生殖细胞分裂较快,因此易受抗癌药物影响,特别是烷化剂,如环磷酰胺和噻替派容易引起男性患者睾丸萎缩、精子减少,而甲基苄肼、环磷酰胺等也常导致女性患者卵巢功能受损、子宫内膜增生、无月经及不育等。故化疗对病人生育能力有影响,但一般停药后多能恢复。
另外许多化疗药有致畸胎作用,可引起胎儿脑积水、兔唇、腭裂、肾输尿管缺损、四肢等多处畸型。故妊娠期妇女尽可能不做化疗,男性患者化疗期间也应节育或避孕。