1985年reeders等采用基因连锁的方法成功地诊断了
多囊肾,开创了分子诊断多囊
肾病的先河。目前分子诊断已被越来越广泛地应用,主要包括以下方法。
1. 基因连锁分析 自1985年首次采用基因连锁分析将pkd1基因定位于第16染色体以来,国内外先后开展了基因连锁分析诊断多囊肾的工作。目前发现的与pkd1基因连锁的微卫星遗传标记有:sm6、sm7、cw2、cw4、ac2.5、kg8、sⅲ6等。新近使用毛细管电泳-基因扫描技术使基因连锁分析更精确、检出率更高。基因连锁分析方法虽简便易行,但缺点是患者家族中至少要有其他两名患者提供dna样本,父母必须是杂合子。
2. 单链构象多态性分析 单链构象多态性分析(single-stranded conformational polymorphism, cp)是指人染色体基因组dna中的单个核苷酸突变,引起突变前后dna在变性条件下形成的单链在进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳时,由于碱基三维构象不同,导致迁移速度出现差异的检测方法。多囊肾患者体内存在多个pkd基因突变,利用 cp分析技术相对简单,可以灵敏地揭示发生在150-200 dna上的点突变,对单个位点变异所致的致病基因突变检出率高。然而,由于pkd致病基因一致性和突变位点不固定性, cp检测方法仍有5%~30%漏检率。
3. 变性高效液相色谱分析 变性高效液相色谱(denaturing high performance liquid chromatography, dhplc)是利用离子对反向液相色谱技术,通过dna分离基质,对特定pcr反应产物进行分离。dhplc能通过温度调节的异源双链分析,自动检测单碱基替换、小片段插入和缺失等基因序列的改变。dhplc具有灵敏性高、特异性强、省时省力且成本低等优点。采用dhplc技术检测多囊肾突变检出率高达95%以上,最大检测片段可达1.5 kb,是近年来较成熟、应用最普遍的多囊肾分子诊断方法。
4. 其他 除以上几种方法外,还有rnase酶切保护法、荧光素原位杂交(floresence in situ hybridization, fish)技术等,应用相对较少。