最常见的并发症,应属重建尿道后因伤口愈合不佳而生成的瘘管。这种并发症与血肿形成、伤口感染、重建的尿道过长、使用的皮不够且张力太大或手术的技巧与材料不良等因素均有关系。为了减少瘘管的发生,对于尿道下裂情况严重的病人,应分多次手术,并尽量避免产生血肿及伤口的感染。使用的皮尽量少去创伤并且要有足够的血液供应,采用无反应的缝线及精小的器械,减少异物的存留及缝合处的张力,增加接触面积,改善手术的技巧和施以适当的尿液导流。手术后伤口裂开、尿道及尿道口狭窄、尿道憩室或排尿困难等情形亦偶而可发生,均为技术问题,应可避免。
手术后的护理,对手术成败的影响甚大。手术后一定要保持导尿管的通畅,维持适宜的压迫性敷料至少3-5天,并且每天以少许的消毒油剂润滑敷料,以防止敷料与皮肤粘着、而于拆除敷料时撕裂缝合的伤口,造成瘘管。同时,要避免阴茎勃起,以免影响伤口的愈合,所以给予适量的女性激素以予抑制是必要的。通常导尿管于手术后第10~12天拔除。