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“六基症”理论是指赫依、希拉、巴达干、血、协日乌素(黄水)、虫菌等6种病症。《四部医典》没有把“六症”当作“主症”来阐述。伊希巴拉珠尔的《甘露之泉》里写道:“三邪(是指反常的赫依、希拉、巴达干)加血、协日乌素、虫菌3个病症则成‘六症’。”伊氏把这6种病症称为“六基症”,该理论成为蒙医学病因辨证的主要依据。
在这一时期,蒙古传统医药的诊断方法吸收了《四部医典》和其他兄弟民族医学的望、问、触(切)三种诊断法。三种诊断法加上试探法,发展成为蒙医学诊断学。蒙医学家们在继承和发展古代诊断方法和诊断学理论、经验的同时,总结了各自的实践经验并撰写出一些著作。如18世纪罗布桑苏勒和木著的《脉诊概要》就是一部诊断学专著。另外,伊希巴拉珠尔的《甘露之泉》一书中的“疾病辨诊篇”里的“尿诊、脉诊、问诊、经验辨诊、取舍辨诊”等5个章节,《白露医法从新》一书中的“伤科篇”里的“外伤诊法、脱臼诊法、旱獭疫诊法”,《甘露点滴》一书中的“蒙医正脑术”诊法,敏如拉占布拉著的《方海》中的眼科94病症的诊法也都是把蒙古传统诊断法与《四部医典》的理论相结合的诊疗方法。
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