由于失去激素的支持,更年期女性的生殖系统发生萎缩性改变,主要表现在:外阴失去大部分胶原、脂肪和保留水分的能力,腺体萎缩,分泌减少,皮脂腺分泌也减少,皮肤变薄、干、易裂。阴道缩短、变窄,皱褶减少,壁变薄,弹性减弱,分泌减少。早期呈现充血性改变,壁脆易受伤和出血,有弥漫性或散在的淤斑,晚期颜色苍白,粘连带增多。由于阴道的萎缩,使尿道与耻骨联合的角度从90度变为80度。开口接近阴道口,任何阴道操作或性行为可能增加对尿道的压力而发生排尿不适、尿频和感染。宫颈萎缩,分泌黏液减少。子宫萎缩以宫体萎缩为主,内膜变薄。子宫随绝经时间延长继续缓慢缩小。由于腺体和肌层萎缩,部分患有子宫内膜异位症或肌瘤的患者可能因此免去手术。输卵管也萎缩。生殖道的支持结构减弱,盆底松弛,易发生子宫脱垂、膀胱脱垂或直肠脱垂。