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一直以来,研究人员们都在怀疑某种癌症和自身免疫性疾病是由某种细菌或病毒的遗传物质侵入人体的DNA造成的,但是,要鉴别出这些有外来闯入者的DNA是一件非常复杂的事。刊登在《自然—遗传学》在线新闻上的一篇论文报告了一项新的基因技术,这项技术也许将有助于研究人员鉴别出患者基因内闯入的外来细菌。
通过对宫颈癌的研究,可以找到引发癌症的接触传染性疾病的最好证据。人乳头状瘤病毒(HPV)可导致生殖器疣,在超过90%的宫颈肿瘤患者体内已发现了这种疣。哈佛大学医学院的病理学家Matthew Meyerson和他领导的同事们以这种疾病为例来验证外来基因的存在。
通过计算机图书馆,研究小组将7037个来自宫颈癌患者的活跃基因序列与人类基因组项目的基因序列、以及其它人类和老鼠的基因序列进行了对比,这些个体应该都是健康的。其中有24名宫颈癌患者的基因序列与对比的基因不相符合。研究人员剔除了其中的20个。剩下的2个基因序列里有致命的外来闯入者,来自细菌的HPV-18,这是与宫颈癌有关的传染源。
美国斯坦福大学的微生物学家David Relman说这一方法很有前景,但是他也指出:“这一方法面临的挑战是当你所遇到的转录物并不具有类似HPV和宫颈癌一样已知的故事时,(你该怎么办?)”他认为我们的DNA可能会积累少量无害的细菌,这样将病原体的踪迹从那些无害的共生体中分离出来就很困难。